橡胶树HeveaDB基因组数据库平台完成测试

橡胶技术网2020-05-10 13:31:30

  日前,中国热带农业科学院“橡胶树等主要热带作物功能基因组学研究”创新团队负责搭建的橡胶树HeveaDB基因组数据库平台(hevea.catas.cn)上线运行,并在国际橡胶研究与发展委员会(IRRDB)各成员国间开展测试工作。经过1个月的测试,数据库平台各项指标保持稳定,运行可靠,达到预期效果。


  近年来,随着基因组测序技术的进步,已有四个国家(马来西亚、泰国、中国和日本)独立绘制并公开发表了橡胶树基因组草图,其中由中国热带农业科学院橡胶研究所完成的草图版本质量最高。同时还产生了大量转录组数据。这些数据亟需一个整合的数据平台来储存、分发和共享,并进行二次挖掘利用。


  2017年召开的IRC2017国际橡胶会议提出要搭建橡胶树基因组数据中心的计划。在IRRDB理事会上,中国热科院代表经过争取,获得了牵头搭建橡胶树基因组数据中心的任务,并由“橡胶树等主要热带作物功能基因组学研究”创新团队承担开发工作。经过努力,创新团队成功搭建了橡胶树基因组数据库HeveaDB初期版本,并于2018年4月底在国内外开展试运行测试。


  HeveaDB数据库主要储存了橡胶树4个版本的基因组草图、1个遗传图谱、142个转录组数据、49235条EST序列、30200个基因注释、12个基因家族的信息,以及5049个IRRDB 1981’野生种质资源材料和18328个魏克汉材料信息。并以中国热科院橡胶研究所完成的热研7-33-97品种的基因组数据为参考基因组,进行了二次挖掘和分析,进行可视化展示。


  经过1个月的试运行,HeveaDB数据库访问量达到1600余次,共有来自中国、马来西亚、法国、巴西、日本、印度、越南、英国、印度尼西亚等10余个国家和地区的200多位独立访客点击访问,反馈了意见和建议。下一步,将根据建议在数据库易用性、后基因组数据分析等方面进行二次开发和功能升级,并根据橡胶树基因组研究进展及时更新数据内容 。(张晴丹)返回光明网首页






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会议主要内容:


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二、橡胶行业智能化转型升级发展展望(青岛万龙科技集团 董事长 高彦臣 博士)

三、橡胶混炼胶技术与使用交流(芜湖集拓橡胶技术有限公司 吕晓刚  副总)

四、橡胶行业整体解决方案(西邦(中国)三洋     技术总监)

五、乙丙橡胶的技术与应用(宁波SK 爱思开合成橡胶有限公司  朴龙海  技术支持 )

六、浅谈农业机械用轻型V带的设计制造(浙江凯欧传动带股份有限公司 解德利  总工程师)

七、汽车减震橡胶制品技术研究(上海众力部件有限公司 田中龙  橡胶材料开发部经理) 

八、亲水剂在橡胶中的应用(金昌盛集团   技术总监)

九、橡胶制品的模具设计及常见问题分析(厦门永盛欣模具有限公司 文国新 总经理)

十、高性能再生胶在橡胶中的应用(徐州工业职业技术学院 朱信明 教授)

十一、橡胶现场生产管理、乳胶技术专题、疑难解答(宁波捷耀橡胶有限公司  武可迁 总经理)


此外邀请很多橡胶业内知名专家,实力工程师,学院教授前来交流!!


会议日程


6月22日 参会报道,橡胶产品展览,技术沙龙,胶友见面会

6月23日 会议主题,精彩实用内容,橡胶行业讨论交流   橡胶人才艺晚会

6月24日 参观SK橡胶工厂,交流、学习

世界500强公司,韩国SK集团在浙江宁波的一家EPDM工厂,该工厂是与宁波中浦石化投资有限公司合资的,年产量达5万吨,于2014年正式投产。


学习知识,答疑解惑,商务合作,拓宽人脉,结识业内大咖!

会议费用1300元/人(含会费、餐费、房费、礼品),不住1000元。

橡胶胶友会,交流学习合作,只为胶友创造好机会



会议网址:www.sto.net.cn/2018

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